Az emlőben már meglévő – ultrahanggal, mammográfiával már diagnosztizált – daganatok vizsgálatára alkalmazzák leggyakrabban az MR-vizsgálatot. Szűrésre ezt a diagnosztikai módszert nem javasolt használni ugyanis az elváltozás típusa nehezebben azonosítható MR-el, mint más diagnosztikai eljárásokkal.
Kiválóan alkalmas az esetleges nyirokcsomó áttétek fölkutatására, továbbá az emlő implantátumok esetleges sérüléseinek kizárására vagy bizonyítására.