Az ízületeket és a csontokat körülölelő lágyrészeket lehet kiválóan vizsgálni MR vizsgálattal. Láthatóvá válnak az ínak, a szalagok, a porcok, az ízületi belhártya. Az ízületi MR vizsgálat végezhető a láb (térd, boka), a kéz (könyök, váll), a csípő ízületein. A pontos diagnózis érdekében gyakran előfordul, hogy MR-t és ultrahang vizsgálatot is kér az orvos.